બાંગ્લાદેશમાં સત્તા પરિવર્તન દરમિયાન, લઘુમતીઓ, ખાસ કરીને હિન્દુઓ વિરુદ્ધ અમાનવીય ઘટનાઓના અસંખ્ય અહેવાલો બહાર આવ્યા. ભારત સરકારે અનેક વખત આનો વિરોધ કર્યો હતો. તેનાથી વિપરીત, વચગાળાની સરકારના મુખ્ય સલાહકાર મુહમ્મદ યુનુસે હવે હિન્દુ પીડિતોને દેશભક્તિનો ઉપદેશ આપવાનું શરૂ કર્યું છે. તેમણે હિન્દુ સમુદાયના સભ્યોને પોતાને ધાર્મિક લઘુમતી તરીકે નહીં પણ દેશના નાગરિક તરીકે જોવા વિનંતી કરી.

   હકીકતમાં, પત્રકાર મેહદી હસન સાથેની એક મુલાકાતમાં, મુહમ્મદ યુનુસે જણાવ્યું હતું કે આ દેશભક્તિનો અભિગમ સામાજિક એકતાને મજબૂત બનાવશે અને બધા માટે સમાન સુરક્ષા સુનિશ્ચિત કરશે. "જ્યારે હું સમુદાયના નેતાઓને મળું છું, ત્યારે મારો સંદેશ છે: 'હું હિન્દુ છું, તેથી મારી રક્ષા કરો' એમ ન કહો. હંમેશા કહો, 'હું આ દેશનો નાગરિક છું. રાજ્ય દ્વારા પૂરી પાડવામાં આવતી તમામ સુરક્ષાનો મને હક છે.' પછી તમને વ્યાપક કવરેજ મળશે,

  શેખ હસીનાની સરકાર સામેના બળવા પછી, મોહમ્મદ યુનુસને વચગાળાની સરકારના વડા તરીકે નિયુક્ત કરવામાં આવ્યા હતા. તેમને શાંતિ પુરસ્કાર એનાયત કરવામાં આવ્યો છે. એવી ધારણા હતી કે તેમના સત્તામાં આવવાથી બાંગ્લાદેશમાં પરિસ્થિતિ સુધરશે, પરંતુ તેનાથી વિપરીત થયું, કારણ કે હિન્દુઓને ત્યાં રહેવાનું વધુને વધુ મુશ્કેલ બન્યું.

   આ સંદર્ભમાં, મોહમ્મદ યુનુસે હિન્દુઓને સંદેશ આપતા કહ્યું કે બાંગ્લાદેશમાં હિન્દુઓએ અલગતા અનુભવવી જોઈએ નહીં અને મુખ્યત્વે ધર્મ દ્વારા ઓળખાવાને બદલે સંપૂર્ણ નાગરિક તરીકે તેમના અધિકારોનો દાવો કરવો જોઈએ.

આ સમયગાળા દરમિયાન મોહમ્મદ યુનુસે પણ ભારત વિરુદ્ધ ઝેર ઓક્યું. તેમણે બાંગ્લાદેશમાં હિન્દુઓ વિરુદ્ધ સાંપ્રદાયિક હિંસાના આરોપોને ફગાવી દીધા. તેમણે ભારત દ્વારા ફેલાવવામાં આવતા આવા અહેવાલોને ખોટા સમાચાર ગણાવીને તેમની સરકારને સ્વચ્છ દર્શાવવાનો પ્રયાસ કર્યો. મોહમ્મદ યુનુસે કહ્યું કે ભારતની વર્તમાન લાક્ષણિકતાઓમાંની એક નકલી સમાચાર છે... ખોટા સમાચારોનો ભરાવો. તેમણે દાવો કર્યો કે ધાર્મિક હુમલા તરીકે નોંધાયેલી ઘણી ઘટનાઓ ખરેખર જમીન અથવા પડોશી બાબતો પરના સ્થાનિક વિવાદો હતા.

  શેખ હસીનાના રાજીનામા બાદ બાંગ્લાદેશમાં સરકારનું નેતૃત્વ કરી રહેલા મોહમ્મદ યુનુસે હિન્દુઓ અને તેમના દેવી-દેવતાઓના મંદિરો પર થઈ રહેલા હુમલાઓ અંગે કહ્યું કે સરકાર આ મામલે ખૂબ જ સાવધ છે કારણ કે ભારત હંમેશા દબાણ લાવવા માટે આનો ઉપયોગ કરે છે.